个体工商户能否申请代开增值税专用发票

可以的，小规模可以自开专票，个体也可以是一般纳税人。
《国家税务总局关于增值税发票管理等有关事项的公告 国家税务总局公告 2019年第33号》，五、增值税小规模纳税人（其他个人除外）发生增值税应税行为，需要开具增值税专用发票的，可以自愿使用增值税发票管理系统自行开具。选择自行开具增值税专用发票的小规模纳税人，税务机关不再为其代开增值税专用发票。


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